Южане взяли 19-летнего футболиста в аренду на полтора сезона, до конца сезона-2021/22.
Прохин дебютировал в основе «Зенита» 11 июля 2020 года в игре с «Ахматом». В общей сложности он провел в основном составе 11 матчей, включая два в Лиге чемпионов.
В составе сине-бело-голубых Прохин становился чемпионом России (2019/20), обладателем Кубка страны (2019/20) и Суперкубка России-2020.