Участники жеребьевки 1/16 финала разбиты на две корзины. Статус сеяных получили 12 победителей группового этапа, а также четыре лучших клуба из числа занявших третьи места в Лиге чемпионов.
Несеяными будут остальные четыре выходца из Лиги чемпионов и 12 клубов, которые финишировали вторыми на групповом этапе Лиги Европы.
Команды, игравшие на групповом этапе, и представители одной национальной ассоциации не смогут встретиться друг с другом. Согласно решению исполнительного комитета УЕФА, клубы из России и Украины разводятся по разным парам.
Сеяные команды: «Мольде», «Ливерпуль», «Краснодар», «Наполи», «Рапид» Вена, «Брага», «Лацио», «Локомотив» Москва, «Базель», «Тоттенхэм», «Шальке-04», «Атлетик», «Манчестер Юнайтед», «Байер», «Олимпиакос»*, «Порту».
Несеяные команды: «Фенербахче», «Сьон», «Боруссия» Дортмунд, «Митьюлланд», «Вильяреал», «Олимпик», «Сент-Этьен», «Спортинг», «Фиорентина», «Андерлехт», «Спарта», «Аугсбург», «Шахтер» Донецк«, "Галатасарай", "Севилья", "Валенсия".
Матчи этой стадии пройдут 18 и 25 февраля.
Жеребьевка 1/16 финала Лиги Европы состоится 14 декабря в швейцарском Ньоне.