В 2007-м году Баляйкин заключил пятилетний контракт с казанским «Рубином», в составе которого стал двукратным чемпионом России, бронзовым призером первенства страны и участником Лиги Чемпионов. Минувший сезон 24-летний хавбек провел на правах аренды в «Томи».