Последние три сезона 34-летний футболист играл за «Фейенорд». До этого также выступал в составе «Кёге» (Дания, 1992-1994), «Херенвена» (1994-1997), «Ньюкасла» (1997-1998), «Милана» (2002-2005), «Штутгарта» (2005-2007) и «Вильярреала» (2007-2008).
Широкую известность получил все в том же «Фейенорде», за который с 1998 по 2002 года провел 122 матча и забил 54 гола.
Является победителем Лиги чемпионов (2003, «Милан»), Кубка УЕФА (2002, «Фейенорд») и чемпионата Италии (2004, «Милан»).
Томассон - лучший бомбардир в истории сборной Дании – 52 гола в 112 матчах.